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1.
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1528847

ABSTRACT

This study aimed to compare the subgingival microbiota of subjects with and without breast cancer (BC). Patients with BC (Group 1; n= 50) and without BC (Group 2; n=50) with periodontitis (A) and without periodontitis (B). The study was conducted in two phases (P1 and P2). One biofilm sample was collected from each subject and analyzed by DNA-DNA Hybridization (Checkerboard DNA-DNA). The relative abundance of the subgingival microbiota differed between the Case and Control groups. However, some species were higher in patients in the Case than in Control subjects and differed between the groups in both phases. Composition of the subgingival microbial community according to the Socransky complex was related to periodontal disease, followed by clinical attachment of level (CAL ≥4mm), age, and tooth loss, which were found to be abundant in Cases when compared with controls. Patients with Tumor Grade II and III had a higher prevalence of tooth loss and CAL≥4mm. It was concluded that in individuals with BC, the sub-gingival microbiota exhibited atypical changes, but they developed periodontal disease.


El objetivo de este estudio fue comparar la microbiota subgingival de sujetos con y sin cáncer de mama (CM). Pacientes con CM (Grupo 1; n= 50) y sin CM (Grupo 2; n=50) con periodontitis (A) y sin periodontitis (B). El estudio se realizó en das fases (P1 y P2). Se recogió una muestra de biopelícula de cada sujeto y se analizó mediante hibridación ADN-ADN (tablero de ajedrez ADN-ADN). La abundancia relativa de la microbiota subgingival difirió entre los grupos de Caso y Control. Sin embargo, algunas especies fueron más altas en los pacientes del Caso que en los sujetos del Control y difirieron entre los grupos en ambas fases. La composición de la comunidad microbiana subgingival según el complejo de Socransky se relacionó con la enfermedad periodontal, seguida por el nivel de inserción clínica (CAL≥4mm), la edad y la pérdida de dientes, que se mostró abundante en los casos en comparación con los controles. Los pacientes con Tumor Grado II y III tuvieron mayor prevalencia de pérdida dental y CAL≥4mm. Se concluyó que en individuos con CM la microbiota subgingival presentó cambios atípicos, pero sin embargo, desarrollaron enfermedad periodontal.

2.
Biomédica (Bogotá) ; 43(Supl. 1)ago. 2023.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1533891

ABSTRACT

Introducción. La paracoccidioidomicosis es una micosis sistémica y endémica en Latinoamérica. El cambio climático y el movimiento migratorio del huésped enfatizan la necesidad de optimizar el diagnóstico de esta infección. Objetivo. Evaluar la implementación de la detección de ADN de Paracoccidioides spp. al diagnóstico micológico de pacientes con sospecha de paracoccidioidomicosis. Materiales y métodos. Estudio retrospectivo con datos de laboratorio de pacientes con sospecha de paracoccidioidomicosis en un hospital de área no endémica. Resultados. Se analizaron los resultados de las muestras de 19 pacientes con sospecha clínica de paracoccidioidomicosis. El 90 % de los pacientes había nacido o visitado un área endémica de esta micosis en Latinoamérica. En 14 pacientes varones adultos se confirmó paracoccidioidomicosis por diagnóstico convencional. El examen directo fue positivo en 12 pacientes con enfermedad comprobada y en 4 de ellos se obtuvo crecimiento del hongo. Se detectaron anticuerpos contra Paracoccidioides spp. en ocho pacientes con la enfermedad. Se realizó PCR anidada con muestras de 14 pacientes para detectar ADN de Paracoccidioides spp. En 9 de los 10 pacientes con diagnóstico convencional de paracoccidioidomicosis se obtuvo una prueba de PCR positiva. Conclusiones. La implementación de técnicas moleculares para detectar ADN de Paracoccidioides spp. complementa el diagnóstico convencional de paracoccidioidomicosis y permite instaurar el tratamiento antifúngico, sobre todo en los casos clínicos donde no se observa la presencia del hongo en las muestras clínicas. La migración actual de poblaciones humanas dificulta el diagnóstico de paracoccidioidiomicosis y otras infecciones endémicas, por lo que se requiere optimizar el diagnostico micológico en los laboratorios clínicos para tratar pacientes con este tipo micosis desatendida.


Introduction. Paracoccidioidomycosis is a systemic mycosis endemic in Latin America. Climate change and host migration emphasize the need to optimize this infection diagnosis. Objective. To evaluate the implementation of Paracoccidioides spp. DNA detection in the mycological diagnosis of patients with suspected paracoccidioidomycosis. Materials and methods. It is a retrospective study with laboratory data from patients with clinical suspicion of paracoccidioidomycosis, who consulted a university hospital from a non-endemic area. Results. We analyzed the laboratory results of samples from 19 patients with suspected paracoccidioidomycosis. Seventeen out of 19 patients were born in or had visited an endemic area in Latin America. Fourteen adult male patients were confirmed to have paracoccidioidomycosis by conventional diagnosis: the direct examination was positive in 12 samples while fungal growth was found only in 4. Anti-Paracoccidioides spp. antibodies were detected in 10 patients, 8 of them with proven paracoccidioidomycosis. Nested PCR for Paracoccidioides spp. detection was performed on clinical samples from 14 patients, and positive results were obtained for 9 out of 10 patients with the conventional diagnosis of paracoccidioidomycosis. Conclusions. The incorporation of molecular techniques to detect Paracoccidioides spp. DNA complements the conventional diagnosis of paracoccidioidomycosis. This tool allows the prescription of antifungal treatment in those cases where the fungus is not observed in the clinical samples. Current human migrations difficult the mycological diagnosis of paracoccidioidomycosis and other fungal infections. For this reason, it is necessary to improve mycological diagnosis in clinical laboratories to adequately treat patients with this neglected mycosis.

3.
Biomédica (Bogotá) ; 43(Supl. 1)ago. 2023.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1533904

ABSTRACT

Los hongos son organismos polifacéticos presentes en casi todos los ecosistemas de la tierra, donde establecen diversos tipos de simbiosis con otros seres vivos. A pesar de ser reconocidos por los humanos desde la antigüedad -y de la cantidad de trabajos que han profundizado sobre su biología y ecología-, aún falta mucho por conocer sobre estos organismos. Algunos de los criterios que clásicamente se han utilizado para su estudio, hoy resultan limitados y hasta cierto punto permiten un agrupamiento de los aislamientos según algunas características, pero generan confusión en su clasificación y, más aún, cuando se pretende comprender sus relaciones genealógicas. Los caracteres fenotípicos no son suficientes para identificar una especie de hongos y, menos aún, para construir una filogenia amplia o de un grupo particular. Hay grandes vacíos que hacen que los árboles generados sean inestables y fácilmente debatidos. Para los profesionales de la salud, parece que la identificación de los hongos hasta niveles inferiores como género y especie es suficiente para elegir el tratamiento más adecuado para su control, comprender la epidemiología de los cuadros clínicos asociados y reconocer los brotes y los factores determinantes de la resistencia a los antimicrobianos. No obstante, la ubicación taxonómica dentro del reino permitiría establecer relaciones filogenéticas entre los taxones fúngicos, facilitando la comprensión de su biología, su distribución en la naturaleza y la evolución de su potencial patogénico. Los avances de las técnicas de biología molecular y las ciencias de la computación en los últimos 30 años han permitido cambios importantes dirigidos a establecer los criterios para definir una especie fúngica y alcanzar una construcción filogenética más o menos estable. Sin embargo, el camino por recorrer aún es largo, y supone un trabajo mancomunado de la comunidad científica a nivel global y el apoyo a la investigación básica.


Fungi are multifaceted organisms found in almost all ecosystems on Earth, where they establish various types of symbiosis with other living beings. Despite being recognized by humans since ancient times, and the high number of works delving into their biology and ecology, much is still unknown about these organisms. Some criteria classically used for their study are nowadays limited, generating confusion in categorizing them, and even more, when trying to understand their genealogical relationships. To identify species within Fungi, phenotypic characters to date are not sufficient, and to construct a broad phylogeny or a phylogeny of a particular group, there are still gaps affecting the generated trees, making them unstable and easily debated. For health professionals, fungal identification at lower levels such as genus and species, is enough to select the most appropriate therapy for their control, understand the epidemiology of clinical pictures associated, and recognize outbreaks and antimicrobial resistance. However, the taxonomic location within the kingdom, information with apparently little relevance, can allow phylogenetic relationships to be established between fungal taxa, facilitating the understanding of their biology, distribution in nature, and pathogenic potential evolution. Advances in molecular biology and computer science techniques from the last 30 years have led to crucial changes aiming to establish the criteria to define a fungal species, allowing us to reach a kind of stable phylogenetic construction. However, there is still a long way to go, and it requires the joint work of the scientific community at a global level and support for basic research.

4.
Rev. chil. obstet. ginecol. (En línea) ; 88(3): 138-142, jun. 2023. tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1515202

ABSTRACT

Objetivo: Determinar el grupo RhD fetal a través del estudio del gen RHD en ADN fetal que se encuentra libre en plasma de embarazadas RhD negativo. Método: Se analizó la presencia de los genes RHD, SRY y BGLO en ADNfl obtenido de plasma de 51 embarazadas RhD negativo no sensibilizadas, utilizando una qPCR. Los resultados del estudio genético del gen RHD se compararon con el estudio del grupo sanguíneo RhD realizado por método serológico en muestras de sangre de cordón, y los resultados del estudio del gen SRY fueron cotejados con el sexo fetal determinado por ecografía. Se calcularon la sensibilidad, la especificidad, los valores predictivos y la capacidad discriminativa del método estandarizado. Resultados: El gen RHD estaba presente en el 72,5% de las muestras y el gen SRY en el 55,5%, coincidiendo en un 100% con los resultados del grupo RhD detectado en sangre de cordón y con el sexo fetal confirmado por ecografía, respectivamente. Conclusiones: Fue posible deducir el grupo sanguíneo RhD del feto mediante el estudio del ADN fetal que se encuentra libre en el plasma de embarazadas con un método molecular no invasivo desarrollado y validado para este fin. Este test no invasivo puede ser utilizado para tomar la decisión de administrar inmunoglobulina anti-D solo a embarazadas RhD negativo que portan un feto RhD positivo.


Objective: To determine the fetal RhD group through the study of the RHD gene in fetal DNA found free in plasma of RhD negative pregnant women. Method: The presence of the RHD, SRY and BGLO genes in fetal DNA obtained from plasma of 51 non-sensitized RhD negative pregnant women was analyzed using qPCR. The results of the genetic study of the RHD gene were compared with the RhD blood group study performed by serological method in cord blood samples, and the results of the SRY gene study were compared with the fetal sex determined by ultrasound. Sensitivity, specificity, predictive values and discriminative capacity of the standardized method were calculated. Results: The RHD gene was present in 72.5% of the samples and the SRY gene in 55.5%, coinciding 100% with the results of the RhD group detected in cord blood, and with the fetal sex confirmed by ultrasound, respectively. Conclusions: It was possible to deduce the RhD blood group of the fetus through the study of fetal DNA found free in the plasma of pregnant women with a non-invasive molecular method developed and validated for this purpose. This non-invasive test can be used to make the decision to administer anti-D immunoglobulin only to RhD-negative pregnant women carrying an RhD-positive fetus.


Subject(s)
Humans , Female , Pregnancy , Rh-Hr Blood-Group System/genetics , DNA , Erythroblastosis, Fetal/diagnosis , Erythroblastosis, Fetal/genetics , Phenotype , Prenatal Diagnosis , Rh-Hr Blood-Group System/blood , Predictive Value of Tests , Sensitivity and Specificity , Rho(D) Immune Globulin , Genes, sry/genetics , Erythroblastosis, Fetal/blood , Fetal Diseases/diagnosis , Fetal Diseases/genetics , Fetal Diseases/blood , Genotype
5.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1551114

ABSTRACT

La obtención de ADN de moscas de interés médico-legal es de relevancia para una variedad de aplicaciones. Aunque existen métodos de extracción comerciales de ADN, su uso rutinario es limitado, en algunos escenarios. En este contexto, el uso de métodos no comerciales constituye una alternativa; sin embargo, su optimización es clave para mejorar el flujo de trabajo y los resultados. Este trabajo evaluó el impacto de variaciones a un método de precipitación salina sobre la concentración y la pureza del ADN recuperado. No se encontraron diferencias significativas en la concentración de ADN extraído entre los diferentes tiempos de incubación, probados durante la fase de extracción, mientras que el incremento en el volumen de etanol absoluto, en la fase de precipitación de ADN, mejoró significativamente la concentración de ADN obtenido. Las modificaciones propuestas reducen el tiempo de ejecución y la concentración de ADN obtenido comparado con el protocolo original.


Obtaining DNA from flies of medico-legal interest is relevant for a variety of applications. Although commercial extraction methods offer optimal DNA, their routine use is limited in some settings. In this context, the use of non-commercial methods constitutes an alternative in laboratories with limited resources however, its optimization is key to improving the workflow and the results. This work evaluated the impact of variations to a saline precipitation method on the concentration and purity of the recovered DNA. No significant differences were found in the concentration of extracted DNA between the different incubation times tested during the extraction phase. In contrast, the increased volume of absolute ethanol in the DNA precipitation phase significantly improved the concentration of DNA obtained. The proposed modifications reduce the runtime and DNA concentration obtained compared with the original protocol.

6.
Rev. Fac. Med. Hum ; 23(2)abr. 2023.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1514788

ABSTRACT

Introducción: La toxicidad del plomo se ha relacionado a diferentes patologías en humanos y varias evidencias sugieren una fuerte relación con el daño observado sobre la función reproductiva en humanos y roedores. Método: Se proporcionó a ratones una dosis única de nitrato de plomo (NP) (50mg/kg/pc), los cuales fueron eutanizados siete días postinyección con el objetivo de evaluar los espermatozoides que han salido de los túbulos seminíferos y están en tránsito por el epidídimo; además, se evaluó la fragmentación del ADN espermático mediante el ensayo tunel. Resultados: La disminución del peso corporal en ratones, tratados con NP (p 0,05); de igual manera, los valores fisiológicos como conteo y movilidad espermática no disminuyeron con el tratamiento (p > 0.05). El tránsito y maduración de los espermatozoides en el epidídimo no sería afectado por el NP, y al no observar aumento en la fragmentación del ADN espermático en el grupo tratado (p > 0,05), la protaminación espermática estaría cumpliendo su rol protector sobre el material genético murino, por lo que no hubo daños genotóxicos por el NP. Conclusión: La administración intraperitoneal de 50mg/kg/pc de NP, por siete días, no causa toxicidad sistémica ni efecto en la espermatogénesis en ratón.


Introduction: Lead toxicity has been linked to different diseases in humans and several evidences suggest a strong relationship with the observed damage on reproductive function in humans and rodents. Methods: Mice were given a single dose of lead nitrate (NP) (50mg/kg/bw), which were euthanized seven days post-injection with the aim of evaluating sperm to come out from the seminiferous tubules and are in transit through the epididymis. Also, the Tunel test was done to evaluate the sperm DNA fragmentation. Results: The decrease in body weight in mice treated with ln (p 0.05), in the same way physiological values such as sperm concentration and motility didn´t decrease with the treatment (p > 0.05). Transit and sperm maturation in the epididymis would not be affected by the ln, and because we did not observe increased sperm DNA fragmentation in the treated group (p > 0.05), sperm protamination would be fulfilling its protective role on murine genetic material avoiding genotoxic damage by ln. Conclusion: The intraperitoneal administration of 50mg/kg/pc of ln for seven days does not cause systemic toxicity or effect on spermatogenesis in mice.

7.
Rev. peru. med. exp. salud publica ; 40(1): 79-85, ene. 2023. ilus, tab, map
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1442123

ABSTRACT

Se evaluó la prevalencia de infección por parásitos tripanosomátidos en Didelphis marsupialis y su relación con los aspectos morfológicos/etarios en una zona rural de El Carmen de Bolívar, Colombia. En cinco visitas (2018-2019) se instalaron trampas Tomahawk® en los ecótopos peridoméstico y silvestre en la Vereda El Alférez, durante tres noches consecutivas/visita. A los animales recolectados, se les determinaron medidas corporales, sexo y edad; y se les extrajo sangre por cardiopuntura, previa sedación, para extracción del ácido desoxirribonucleico (ADN) total y amplificación de la región conservada del ADN de minicírculos de kinetoplasto (ADNk) de parásitos tripanosomátidos. La asociación entre parámetros morfológicos de los didélfidos y su frecuencia de infección por parásitos tripanosomátidos fue determinada mediante una regresión binomial. Se recolectaron 30 individuos de D. marsupialis (60,0% hembras y 40,0% machos/66,7% adultos y 33,3% juveniles). El diagnóstico molecular reveló una frecuencia de infección por parásitos tripanosomátidos del 46,7%. El estadio (p=0,024) fue determinante para la infección. Se discute el papel de D. marsupialis como potencial reservorio de parásitos tripanosomátidos en la zona evaluada.


We studied the prevalence of infection by trypanosomatid parasites in Didelphis marsupialis and its relationship with morphological/age aspects in a rural area of El Carmen de Bolivar, Colombia. Five visits were made to the Vereda El Alférez; each of which lasted three consecutive nights. During these visits, Tomahawk® traps were installed in the peridomestic and wild ecotopes of the Vereda El Alférez. Body measurements, sex and age were determined from the collected animals. Blood was extracted by cardiopuncture, after sedation, in order to obtain total deoxyribonucleic acid (DNA) and amplify the conserved region of the kinetoplast minicircle DNA (kDNA) of parasitic trypanosomatids. The association between morphological parameters of didelphids and their frequency of infection by parasitic trypanosomatids was determined by binomial regression. Thirty D. marsupialis specimens (60.0% females and 40.0% males/66.7% adults and 33.3% juveniles) were collected. Molecular diagnosis revealed a frequency of trypanosomatid parasite infection of 46.7%. Stage (p=0.024) was a determinant for infection. We discuss the role of D. marsupialis as a potential reservoir of parasitic trypanosomatids in the Vereda El Alférez.


Subject(s)
Animals , Bacterial Zoonoses , Marsupialia , Leishmaniasis
8.
Rev. peru. biol. (Impr.) ; 30(1)ene. 2023.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1450331

ABSTRACT

Echiophis brunneus, comúnmente conocida como anguila pecosa, es una especie bentónica costera de la familia Ophichthidae. Su distribución se reporta para el Pacífico Oriental desde el Golfo de California (EE. UU.) hasta el Golfo de Guayaquil (Ecuador). Se reporta por primera vez la presencia de E. brunneus en el norte del Perú a partir de tres ejemplares capturados. Así mismo se registra una nueva talla máxima para la especie y se adiciona la secuencia COI a la base de datos BoldSystems. Una de las principales características para su determinación fue la presencia del diente canino grande localizado en la zona distal del vómer. Las distancias genéticas entre E. brunneus con E. punctifer y E. intertinctus fueron de 0.087±0.013 y 0.095±0.014 respectivamente. Con este trabajo se amplía la distribución geográfica de E. brunneus hasta Salaverry (08°13'28"S, 78°59'22"W), así mismo sugerimos el posible establecimiento de una población de esta especie en la costa norte del Perú.


Echiophis brunneus, commonly known as fangjaw eel, is a coastal benthic species belonging to the Ophichthidae family. Its distribution is reported to be in the Eastern Pacific from the Gulf of California (USA) to the Gulf of Guayaquil (Ecuador). In this study, we report for the first time the presence of E. brunneus based on three specimens captured in northern Peru. Additionally, a new maximum size for the species is recorded, and the first COI sequence is added to the BoldSystems database. One of the main characteristics for its determination was the presence of a large canine tooth located in the distal area of the vomer. The genetic distances between E. brunneus with E. punctifer and E. intertinctus were 0.087±0.013 and 0.095±0.014 respectively. With this work the geographical distribution of E. brunneus is extended to Salaverry (08°13'28"S, 78°59'22"W). We also suggest the possible establishment of a population of this species on the northern coast of Peru.

9.
Rev. Investig. Innov. Cienc. Salud ; 5(1): 75-90, 2023. tab, ilus
Article in Spanish | LILACS, COLNAL | ID: biblio-1509695

ABSTRACT

Introducción. El trastorno del espectro autista (TEA) es un trastorno del neurodesarrollo que provoca déficits en áreas cognitivas y motoras y es causado por varios mecanismos, entre ellos la regulación epigenética. Los procesos epigenéticos pueden verse influenciados por factores ambientales como el ejercicio físico. Objetivo. Analizar el efecto de un programa de ejercicio físico aeróbico (EFA) en el tiempo de reacción simple (TRS) y la metilación del ADN de la isla 2 del gen SHANK3 en niños con TEA. Materiales y métodos. Estudio cuasiexperimental realizado con un grupo de 9 niños (7-11 años) con TEA, que participaron en un programa de EFA de 10 semanas. Las diferencias en el TRS y la metilación de ADN fueron analizadas mediante la prueba de Kruskall-Wallis, considerando un nivel de significancia de p<0.05.Resultados. La mediana del TRS disminuyó después del programa de entrenamiento. Sin embargo, no se encontró una diferencia estadísticamente significativa (p=0.53). Se observó un patrón de hipermetilación en 11 de los dinucleótidos, tanto antes como después del entrenamiento, y se encontró una diferencia estadísticamente significativa en la posición CpG108 (p=0.032). Conclusión. Un programa de entrenamiento basado en EFA de intensidad moderada a vigorosa tiene el potencial de modificar el TRS y la metilación del ADN en niños con TEA. No obstante, es necesario realizar nuevos estudios con muestras más grandes y en los que se analicen más genes, para corroborar los resultados aquí descritos y fortalecer el conocimiento sobre el efecto del ejercicio en los procesos epigenéticos de esta población


Introduction. Autism spectrum disorder (ASD) is a neurodevelopmental disorder that produces cognitive and motor deficits and it is caused by several mechanisms, including epigenetic regulation. Epigenetic processes can be influenced by environ-mental factors such as physical exercise.Objective. To analyze the effect of an aerobic physical exercise (APE) program on simple reaction time (SRT) and DNA methylation of island 2 of the SHANK3 gene in children with ASD.Materials and methods. A quasi-experimental study was carried out on a group of 9 children (7-11 years old) with ASD, who participated in a 10-week APE program. Differences in SRT and DNA methylation were analyzed using the Kruskall-Wallis test by considering a significance level p<0.05.Results. The median SRT decreased after the training program. However, no sta-tistically significant difference was found (p = 0.53). A pattern of hypermethylation was observed in 11 dinucleotides, both before and after training, and a statistically significant difference was found in the CpG108 position (p = 0.032).Conclusion. A moderate to vigorous intensity of APE program has the potential to modify SRT and DNA methylation in children with ASD. However, it requires further studies with larger samples in which more genes are analyzed, to corroborate the results described here and strengthen knowledge about the effect of exercise on the epigenetic processes of this population

10.
Odovtos (En línea) ; 24(3)dic. 2022.
Article in English | LILACS, SaludCR | ID: biblio-1406164

ABSTRACT

Abstract The objective of this study was to determine the gingival state and presence of red complex bacteria in saliva samples of 12-year-old schoolchildren. A calibrated periodontist evaluated biofilm index (BI) (Silness and Löe, 1964), presence of calculus, and gingival index (GI) (Silness and Löe, 1967) in sixty two 12-year-old students of Carmen Lyra School. Saliva samples were collected from each student. The DNA of each sample was extracted and amplified by the polymerase chain reaction (PCR) technique, using specific primers. The BI was 1.18. Calculus was present in 40.40% of the schoolchildren examined; 19.4% was supragingival calculus and 21% both supragingival and subgingival calculus. The GI was 0.97, which according to Silness and Löe is mild gingivitis. Gingivitis was present in 96.8% of the children examined. Regarding the PCR tests: 18 of the samples (31.58%) did not present any of the bacteria analyzed and the remaining 39 samples (68.42%) were positive for at least the presence of red complex bacteria. Within the limitations of this study, it is concluded that the prevalence of gingivitis and calculus is high in the sample examined, and the gingival state observed in the study population, may be related to the presence of red complex bacteria.


Resumen El objetivo de este estudio era determinar el estado gingival y la presencia de bacterias del complejo rojo en muestras de saliva de niños de 12 años de la Escuela Carmen Lyra. Una periodoncista calibrada evaluó en 62 estudiantes de 12 años de la Escuela Carmen Lyra, el índice de biofilme (IB) (Silness y Löe, 1964), la presencia de cálculo y el índice gingival (IG) (Silness y Löe, 1967). Se recolectaron muestras de saliva de cada estudiante. El ADN de cada muestra fue extraído y amplificado por medio de la prueba PCR, empleando primers específicos, para determinar la presencia de bacterias del complejo rojo. El IB fue de 1.18. El cálculo estuvo presente en el 40.40% de la muestra, se encontró 19.4% de cálculo en supragingival y 21% tanto en supragingival como en subgingival. El IG fue de 0.97, que de acuerdo con Silness y Löe es una gingivitis leve. La gingivitis estuvo presente en el 96.8 % de los niños examinados. Con respecto a las pruebas PCR: 18 de las muestras (31.58 %) no presentaron ninguna de las bacterias analizadas y las 39 muestras restantes (68.42%) fueron positivas por lo menos a la presencia de las bacterias del complejo rojo. Dentro de las limitaciones de este estudio, se concluye que la prevalencia de gingivitis y cálculo es alta en la muestra examinada y el estado gingival observado puede estar relacionado con la presencia de bacterias del complejo rojo.


Subject(s)
Humans , Child , Gingival Diseases , Gingivitis/diagnosis , Costa Rica
11.
Rev. biol. trop ; 70(1)dic. 2022.
Article in English | LILACS, SaludCR | ID: biblio-1387717

ABSTRACT

Abstract Introduction: There is low evidence of genetic diversity and hybridization processes within Crocodylus acutus and C. moreletii populations. Objetive: To evaluate genetic diversity and some phylogenetic relationships in wild and captive populations of C. acutus and C. moreletii using the Barcode of Life Data System (COX1, cytochrome C oxidase subunit 1 gene). Methods: 28 individuals phenotypically like C. acutus located in the state of Guerrero, Oaxaca and Quintana Roo were sampled, as well as animals belonging to C. moreletii located in the states of Tabasco, Campeche, and Quintana Roo. 641 base pairs of nucleotide sequence from COX1 were used to obtain the haplotype and nucleotide diversity per population, and a phylogenetic and network analysis was performed. Results: Evidence of hybridization was found by observing C. moreletti haplotypes in animals phenotypically determined as C. acutus, as well as C. acutus haplotypes in animals classified as C. moreletti. Low haplotypic diversity was observed for C. acutus (0.455 ± 0.123) and for C. moreletii (0.505 ± 0.158). A phylogenetic tree was obtained in which the sequences of C. acutus and C. moreletii were grouped into two well-defined clades. Organisms identified phenotypically as C. acutus but with C. moreletii genes were separated into a different clade within the clade of C. moreletii. Conclusions: There are reproductive individuals with haplotypes different from those of the species. This study provides a small but significant advance in the genetic knowledge of both crocodile species and the use of mitochondrial markers, which in this case, the COX1 gene allowed the detection of hybrid organisms in wild and captive populations. Conservation efforts for both species of crocodiles should prevent the crossing of both threatened species and should require the genetic identification of pure populations, to design effective conservation strategies considering the possibility of natural hybridization in areas of sympatry.


Resumen Introducción: Existe poca evidencia de la diversidad genética y los procesos de hibridación dentro de las poblaciones de Crocodylus acutus y C. moreletii. Objetivo: Evaluar la diversidad genética y algunas relaciones filogenéticas en poblaciones silvestres y cautivas de C. acutus y C. moreletii utilizando el Sistema de Código de Barras de la vida (COX1, subunidad I del gen del citocromo C oxidasa). Métodos: Se muestrearon 28 individuos fenotípicamente similares a C. acutus ubicados en los estados de Guerrero, Oaxaca y Quintana Roo, así como animales pertenecientes a C. moreletii ubicados en los estados de Tabasco, Campeche y Quintana Roo. Se utilizaron 641 pares de bases de la secuencia de nucleótidos de la subunidad I del gen del citocromo C oxidasa para obtener el haplotipo y la diversidad de nucleótidos por población, y se realizó un análisis filogenético y de redes. Resultados: Se encontró evidencia de hibridación al observar haplotipos de C. moreletti en animales determinados fenotípicamente como C. acutus, así como haplotipos de C. acutus en animales clasificados como C. moreletti. Se observó una baja diversidad haplotípica para C. acutus (0.455 ± 0.123) y para C. moreletii (0.505 ± 0.158). Se obtuvo un árbol filogenético en el que las secuencias propias de C. acutus y C. moreletii se agruparon en dos grandes y bien definidos clados. Los organismos identificados fenotípicamente como C. acutus pero con genes de C. moreletii se separaron en un clado diferente dentro del clado de C. moreletii. Conclusiones: Existen individuos reproductores con haplotipos diferentes a los de la especie. Este estudio aporta un pequeño pero significativo avance en el conocimiento genético tanto de las especies de cocodrilos como del uso de marcadores mitocondriales, que, en este caso, el gen COX1 permitió la detección de organismos híbridos en poblaciones silvestres y cautivas. Los esfuerzos de conservación para ambas especies de cocodrilos deben evitar el cruce de ambas especies amenazadas y deben requerir la identificación genética de poblaciones puras, para diseñar estrategias de conservación efectivas considerando la posibilidad de hibridación natural en áreas de simpatría.


Subject(s)
Animals , Alligators and Crocodiles/genetics , Mexico , Electronic Data Processing
12.
BAG, J. basic appl. genet. (Online) ; 33(1): 9-25, Oct. 2022. graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1420282

ABSTRACT

ABSTRACT Chile is located in the south-western region of South America along the Pacific Ocean and contributes to the worldwide flora with ca. 6,120 species of Bryophyta, Pteridophyta, Pinophyta, Gnetophyta, and Magnoliophyta (1.9% of worldwide total species), exhibiting high endemism across all plant divisions. Little is known about the genetic diversity of Chilean land plants worldwide, including their cytogenetic and molecular characteristics. In 2012 we published the first state-of-the-art review in Cytogenetics of Chilean Angiosperms. The article gathered 78 publications from 1924 to 2010 accounting for approximately 139 species (2.8% of total Chilean species). The aim of this paper was to review the advances in cytogenetic studies of Chilean land plants, reporting additional cytogenetic data for species of four botanical divisions until 2020. Cytogenetic data were searched in the CPCD (Chilean Plants Cytogenetic Database). In total, we found 180 publications from both Chilean and foreign researchers. To date, cytogenetic data have been reported for 499 Chilean land plant species (8.2% of total) belonging to 244 genera and 117 families. In this context, the 2001-2020 period has been among the most productive regarding publications, with 74 available reports that include 163 additional species. Based on chromosome numbers, angiosperms and bryophytes registered the greatest diversity with 55 and 29 different 2n, respectively; both divisions having the greatest number of studied species. Given the importance of increasing information on Chilean land plants, it is expected that more publications will contribute to the knowledge of their cytogenetic diversity in the near future.


RESUMEN Chile está ubicado en la región suroeste de América del Sur a lo largo del Océano Pacífico y contribuye a la flora mundial con aproximadamente 6.120 especies de Bryophyta, Pteridophyta, Pinophyta, Gnetophyta y Magnoliophyta (1,9% del total de especies en todo el mundo), que presentan un alto endemismo en todas las divisiones de plantas. Poco se conoce sobre la diversidad genética de las plantas terrestres chilenas en todo el mundo, incluidas sus características citogenéticas y moleculares. En 2012 publicamos la primera revisión sobre el estado del arte en Citogenética de Angiospermas Chilenas. El artículo reunió 78 publicaciones desde 1924 hasta 2010, que representan aproximadamente 139 especies (2,8% del total de especies chilenas). El objetivo de este trabajo fue revisar los avances en estudios citogenéticos de plantas terrestres chilenas, reportando datos citogenéticos adicionales para especies de cuatro divisiones botánicas hasta el 2020. Los datos citogenéticos se buscaron en el CPCD (Base de Datos Citogenéticos de Plantas Chilenas). En total, encontramos 180 publicaciones sobre citogenética de plantas terrestres chilenas, con datos citogenéticos para 499 especies (8,2% del total) pertenecientes a 244 géneros y 117 familias. En este contexto, el período 2001-2020 ha sido uno de los más productivos en cuanto a publicaciones, con 74 artículos disponibles que incluyen 163 especies adicionales. Basado en los números cromosómicos, angiospermas y briófitos registran la mayor diversidad, con 55 y 29 2n diferentes, respectivamente; ambas divisiones tienen también el mayor número de especies estudiadas. Dada la importancia de incrementar la información sobre plantas terrestres chilenas, se espera que más publicaciones contribuyan al conocimiento de su diversidad citogenética en un futuro próximo.

13.
BAG, J. basic appl. genet. (Online) ; 33(1): 51-59, Oct. 2022. graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1420285

ABSTRACT

ABSTRACT Important changes in vegetation types occur along elevational gradients. The genus Gymnocalycium is endemic to southern South America, and its species are distributed along elevational gradients. In particular, Gymnocalycium quehlianum is a globular cactus endemic to the Sierras de Córdoba. Studying cytogenetic aspects and DNA content in populations throughout their distribution is key to understanding the species. DNA content and cytogenetic characteristics were analyzed in four populations of G. quehlianum (615, 744, 948 and 1257 masl). The genome size in the four populations varied between 3.55 and 4.30 pg. The populations were diploid (2n = 22). All populations showed the karyotype formula of 10 metacentrics (m) + 1 submetacentric (sm). The species presented symmetrical karyotypes and constitutive heterochromatin CMA+/DAPI- associated with nucleolar organizing regions, always found in the first pair of m chromosomes. The 18-5.8-26S rDNA locus is found in the terminal regions of the first pair of chromosomes m, and the 5S locus is adjacent to the 18-5.8-26S locus. A tendency for DNA content to decrease with increasing altitude was observed.


RESUMEN A lo largo de los gradientes altitudinales se producen cambios importantes en los tipos de vegetación. El género Gymnocalycium es endémico del sur de América del Sur y sus especies se distribuyen en gradientes altitudinales. En particular, Gymnocalycium quehlianum es un cactus globular endémico de las Sierras de Córdoba. Estudiar aspectos citogenéticos y de contenido de ADN en las poblaciones a lo largo de su distribución es clave para comprender a la especie. En cuatro poblaciones de G. quehlianum (615, 744, 948 y 1257 msnm) se analizaron el contenido de ADN y las características citogenéticas. El tamaño del genoma en las cuatro poblaciones varió entre 3,55 y 4,30 pg. Las poblaciones resultaron diploides (2n=22). Todas las poblaciones presentaron la fórmula del cariotipo de 10 metacéntricos (m) + 1 submetacéntrico (sm). La especie presentó cariotipos simétricos y heterocromatina constitutiva CMA+/DAPI- asociados con regiones organizadoras nucleolares, que siempre se encontraban en el primer par de cromosomas m. El locus de ADNr 18-5.8-26S se encuentra en las regiones terminales del primer par de cromosomas m y el locus de 5S está adyacente al locus 18-5.8-26S. Se observó una tendencia del contenido de ADN a disminuir con el aumento de la altitud.

14.
Rev. peru. biol. (Impr.) ; 29(4)oct. 2022.
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1424293

ABSTRACT

Mulinia lateralis is a native bivalve from the Western Atlantic Ocean, distributed from the Gulf of Saint Lawrence in Canada to Yucatan in Mexico. Based on morphological and genetic data of specimens collected in shrimp farms, in this work, we confirm the presence of M. lateralis in the Gulf of Guayaquil, Ecuador. Presence and its consequences of this invasive bivalve in the region is discussed.


Mulinia lateralis es un bivalvo nativo de las aguas del Océano Atlántico Occidental, distribuido desde el Golfo de Saint Lawrence en Canadá hasta Yucatán en México. En este trabajo, la presencia de M. lateralis es confirmada en el Golfo de Guayaquil, Ecuador, con base en datos morfológicos y genéticos de ejemplares colectados en camaroneras. Se presenta una discusión sobre la presencia y consecuencias de este bivalvo invasor en la región.

15.
Rev. peru. med. exp. salud publica ; 39(3): 312-320, jul.-sep. 2022. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1410010

ABSTRACT

RESUMEN Objetivo. Desarrollar y evaluar un método de bajo costo basado en celulosa para la purificación rápida y amplificación directa de ADN de Bordetella pertussis de hisopados nasofaríngeos. Materiales y métodos. Se prepararon discos de celulosa y se evaluaron diferentes parámetros (buffers de lisis/lavado, número de discos y elución de ADN). El método se acopló a una amplificación directa por PCR en tiempo real (qPCR) y se estimó el rendimiento utilizando hisopados nasofaríngeos que fueron positivos (n=100) y negativos (n=50) para ADN B. pertussis por qPCR, comparado con el método basado en columnas de sílice. Se calculó el grado de concordancia, sensibilidad, especificidad, valor predictivo positivo (VPP) y valor predictivo negativo (VPN). Se evaluó la factibilidad del método rápido para ser acoplado a un ensayo colorimétrico de amplificación isotérmica mediada por lazo (LAMP). Resultados. El método rápido con un disco de celulosa y buffer de lisis y lavado conteniendo PVP-40 y Tween 20, respectivamente, mostró una mayor capacidad para purificar ADN amplificable de B. pertussis. El método tuvo una sensibilidad de 89,0% (IC95%, 80,2%-94,9%) y una especificidad de 98,5% (IC95%, 92,1%-100,0%), con un buen grado de concordancia (Kappa=0,867; IC95% 0,788 - 0,946), respecto al método referencial. Los VPP y VPN fueron 98,6% (IC95%, 92,7,2%-100,0%) y 88,2% (IC95%, 78,7%-94,4%), respectivamente. Se evidenció una amplificación exitosa por LAMP, y se obtuvieron resultados comparables con el método por columnas de sílice. Conclusión. El método desarrollado es simple, de bajo costo y libre de equipos para la obtención rápida (60 segundos) de ADN en el punto de atención, y puede ser implementado en diversas técnicas moleculares orientados al diagnóstico oportuno y al estudio epidemiológico de tos ferina.


ABSTRACT Objective. To develop and evaluate a low-cost cellulose-based method for rapid purification and direct amplification of Bordetella pertussis DNA from nasopharyngeal swabs. Materials and methods. We prepared cellulose discs and evaluated different parameters (lysis/wash buffers, number of discs and DNA elution). The method was coupled to a direct real-time PCR (qPCR) amplification and the performance was estimated using nasopharyngeal swabs that were positive (n=100) and negative (n=50) for B. pertussis DNA by qPCR, compared to the silica column-based method. We calculated sensitivity, specificity, positive predictive value (PPV) and negative predictive value (NPV) and the degree of agreement. The feasibility of the rapid method to be coupled to a loop-mediated isothermal amplification colorimetric assay (LAMP) was evaluated. Results. The rapid method, with a cellulose disk and lysis and wash buffer containing PVP-40 and Tween 20, respectively, showed a greater capacity to purify amplifiable DNA from B. pertussis. The method had a sensitivity of 89.0% (95%CI: 80.2%-94.9%) and a specificity of 98.5% (95%CI: 92.1%-100.0%), with a good degree of agreement (Kappa=0.867; 95%CI: 0.788 - 0.946), compared to the reference method. The PPV and NPV were 98.6% (95%CI: 92.7.2%-100.0%) and 88.2% (95%CI: 78.7%-94.4%), respectively. Successful amplification by LAMP was evident, and comparable results were obtained with the silica column method. Conclusion. The developed method is simple, low-cost and equipment-free for rapid (60 seconds) DNA collection at the point of care, and can be implemented in various molecular techniques aimed at the timely diagnosis and epidemiological study of pertussis.


Subject(s)
Humans , Bordetella pertussis/genetics , DNA, Bacterial/isolation & purification , Cellulose , Real-Time Polymerase Chain Reaction , Whooping Cough/diagnosis , Nasopharynx/microbiology , Sensitivity and Specificity , Molecular Diagnostic Techniques
16.
Rev. colomb. bioét ; 17(1)jun. 2022.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1535751

ABSTRACT

Propósito/Contexto. Este artículo analiza aspectos éticos de la edición genética en seres humanos. Metodología/Enfoque. Se describe el desarrollo de las principales aplicaciones de la tecnología genética en prevención, diagnóstico y terapéutica de enfermedades genéticas en las últimas décadas, culminando con la edición genética. Resultados/Hallazgos. Se definen los principales aspectos éticos que presenta la edición genética somática y germinal en seres humanos, incluyendo cuestiones de seguridad, especificidad, precisión y certeza. Se critica la edición genética germinal y el concepto de "mejoramiento" humano por vulnerar la autonomía individual, generar cambios genéticos heredables en la progenie y aceptar la falacia del reduccionismo genético de que los rasgos de las personas dependen exclusivamente de la constitución genética, independiente del ambiente. Discusión/Conclusiones/Contribuciones. La edición genética somática puede ser ética si se siguen las normas éticas de la investigación biomédica. Por el contrario, la edición genética germinal no es pertinente ni necesaria para el tratamiento de enfermedades genéticas y presenta graves conflictos éticos, por lo cual, previo a su aplicación es necesario un consenso social por discusiones democráticas, amplias y profundas entre todos los actores sociales involucrados, seguido de mecanismos de gobernanza con regulación robusta por parte del estado, que impidan la vulneración de derechos humanos fundamentales.


Purpose/Context. This article discusses ethical aspects of gene editing in humans. Methodology/Approach. The main applications of genetic technology in the prevention, diagnosis and therapeutics of genetic diseases in recent decades, are described, culminating with genetic editing. Results/Findings. The main ethical aspects of somatic and germline gene editing in humans are discussed, including issues of safety, specificity, precision and certainty. Germline genetic editing and human "enhancement" are criticized for violating individual autonomy, for generating heritable genetic changes in the progeny and for accepting the fallacy of genetic reductionism that people's traits depend exclusively on genetic makeup, independent of the environment. Discussion/Conclusions/Contributions. Somatic gene editing can be ethical if the ethical standards of biomedical research are followed. However, germline genetic editing is not relevant nor necessary for the treatment of genetic diseases and, furthermore, it presents serious ethical conflicts. Therefore, prior to its application, a social consensus is necessary, obtained by democratic, broad and profound discussions among all the social players involved, followed by governance mechanisms with robust regulation by the state, which prevent the violation of fundamental human rights.


Finalidade/Contexto. Este artigo discute aspectos éticos da edição de genes em humanos. Metodologia/Aproximação. Descreve o desenvolvimento das principais aplicações da tecnologia genética na prevenção, diagnóstico e terapia de doenças genéticas nas últimas décadas, culminando com a edição de genes. Resultados/Descobertas. São definidos os principais aspectos éticos da edição de genes somáticos e da linha germinal no ser humano, incluindo questões de segurança, especificidade, precisão e exactidão. A edição genética da Germline e o conceito de "melhoramento" humano são criticados por violarem a autonomia individual, gerando alterações genéticas hereditárias nos descendentes e aceitando a falácia do reducionismo genético de que as características das pessoas dependem exclusivamente da sua constituição genética, independente do ambiente. Discussão/Conclusões/Contribuições. A edição somática de genes pode ser ética se os padrões éticos da investigação biomédica forem seguidos. Pelo contrário, a edição genética na linha germinal não é relevante nem necessária para o tratamento de doenças genéticas e apresenta graves conflitos éticos. Por conseguinte, antes da sua aplicação, é necessário um consenso social através de discussões democráticas, amplas e profundas entre todos os actores sociais envolvidos, seguidas de mecanismos de governação com regulação robusta por parte do Estado, que impeçam a violação dos direitos humanos fundamentais.

17.
Infectio ; 26(2): 189-192, Jan.-June 2022. tab, graf
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1356267

ABSTRACT

Resumen El molusco contagioso es una infección viral cutánea, usualmente benigna y autolimitada, causada por un virus del género Molluscipoxvirus. Es más frecuente en niños, adultos jóvenes sexualmente activos e inmunosuprimidos. La lesión clínica característica es una pápula umbilicada eucrómica o de tono perlado, que se disemina rápidamente y puede afectar cualquier superficie muco-cutánea, aunque la localización en los párpados es atípica. Se presentan dos casos de pacientes jóvenes inmunosuprimidos, con moluscos contagiosos palpebrales, en quienes el diagnóstico clínico inicial fue incorrecto. Se enfatiza la importancia de diagnosti car oportunamente las lesiones papulares que afectan la piel del párpado ya que la presencia de molusco contagioso en esta zona se considera una manifestación cutánea de inmunosupresión.


Abstract Molluscum contagiosum is a cutaneous viral infection, usually benign and self-limited, caused by the molluscum contagiosum virus, of the genus Molluscipoxvirus. It is more common in pediatric population, sexually active young people and immunosuppressed patients. Clinical presentation is characterized by umbilicated white to flesh-colored or pearly papules, which rapidly spread and can affect any muco-cutaneous membrane. Although the eyelid presentation is atypical, we herein present two young, immunosuppressed patients, with diagnosis of palpebral molluscum contagiosum, in which the initial clinical diagnosis was wrong. We emphasize the importance in making a timely diagnosis of papular lesions localized on the eyelids and the correlation of these lesions as a cutaneous manifestation of immunosuppression.

18.
Rev. peru. med. exp. salud publica ; 39(2): 170-177, abr.-jun. 2022. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1395056

ABSTRACT

RESUMEN Objetivos: Conocer la diversidad genética de Aedes aegypti en el corredor vial transfronterizo Central-Alto Paraná de Paraguay, con registros de casos de dengue. Materiales y métodos: Se seleccionaron veinte hembras adultas de la eclosión de huevos de Ae. aegypti procedentes de casas geolocalizadas en los departamentos de Alto Paraná, Caaguazú, Cordillera y Central, entre el 2018 y 2019. Se extrajo ADN del tejido de las hembras para amplificación aleatoria de sus patrones polimórficos mediante amplificación aleatoria del ADN polimórfico por PCR (RAPD-PCR), usando cebadores H3 y B03 a fin de conocer parámetros genéticos de diversidad poblacional. Las relaciones entre las poblaciones de mosquitos según la localidad fueron visualizadas mediante análisis no apareado de la media aritmética. Las áreas idóneas de distribución geográfica real y potencial de estas poblaciones de Ae. aegypti fueron analizadas mediante DIVA-GIS 7.3.0 y MAXENT. Resultados: Se identificaron 40 loci mediante perfiles RAPD-PCR, con diferenciación génica moderada (Gst = 0,12). El corredor transfronterizo presentó condiciones bioclimáticas para la presencia de poblaciones variantes de Ae. aegypti, siendo determinantes en la distribución la precipitación del trimestre más cálido y la temperatura media del trimestre más seco. Conclusiones: Se evidencia que existe diversidad genética moderada en las poblaciones de Ae. aegypti procedentes de zonas con registros de casos de dengue ubicadas en el corredor vial transfronterizo que une los departamentos Central y Alto Paraná de Paraguay. El estudio de variabilidad genética de Ae. aegypti es de gran utilidad para la vigilancia entomoepidemiológica y evaluación de posibles eventos de resistencia al control químico.


ABSTRACT Objective: To determine the genetic diversity of Aedes aegypti in the Central-Alto Paraná cross-border road corridor of Paraguay, an area that has reports of dengue cases. Materials and methods: Twenty adult females were selected from hatching Ae. aegypti eggs from households geolocated in the departments of Alto Paraná, Caaguazú, Cordillera and Central, between 2018 and 2019. DNA was extracted from the tissue of females for amplifying their polymorphic patterns by random amplification of polymorphic DNA by PCR (RAPD-PCR), using primers H3 and B03 in order to identify genetic parameters of population diversity. The relationships between mosquito populations according to locality were observed by unpaired arithmetic mean analysis. We used DIVA-GIS 7.3.0 and MAXENT to analyze the suitable areas of actual and potential geographic distribution of these Ae. aegypti populations. Results: Forty loci were identified by RAPD-PCR profiling, with moderate gene differentiation (Gst = 0.12). The cross-border corridor presented bioclimatic conditions for the presence of variant populations of Ae. aegypti, with precipitation in the warmest quarter and mean temperature in the driest quarter being determinant in the distribution. Conclusions: There is evidence of moderate genetic diversity in Ae. aegypti populations from areas that have reported dengue cases in the cross-border road corridor linking the Central and Alto Paraná departments of Paraguay. The study of genetic variability of Ae. aegypti is very useful for entomo-epidemiological surveillance and evaluation of possible resistance to chemical control.


Subject(s)
Polymorphism, Genetic , Aedes , Mosquito Vectors , Genetic Variation , Random Amplified Polymorphic DNA Technique , Vector Control of Diseases , Vector Borne Diseases
19.
Acta bioquím. clín. latinoam ; 56(2): 187-193, abr. 2022. graf
Article in Spanish | LILACS, BINACIS | ID: biblio-1402956

ABSTRACT

Resumen El objetivo del estudio fue comparar la extracción de ADN de quistes de Acanthamoeba sp. con un método disponible comercialmente y cuatro no comerciales utilizando tratamiento térmico y ultrasonido para la amplificación por una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) convencional, reduciendo tiempos de preparación y extracción de las muestras, como una herramienta para el diagnóstico en el laboratorio clínico. Se utilizó una cepa de Acanthamoeba, genotipo T4, cultivada en agar no nutritivo. Los quistes para analizar, en tres períodos de enquistamiento, se almacenaron a temperatura ambiente. Se extrajo ADN mediante cinco métodos: pretratamiento térmico, ultrasonido y combinaciones de ellos. La PCR se llevó a cabo utilizando cebadores específicos JDP1/JDP2. La concentración y pureza del ADN extraído con los protocolos evaluados revelaron diferencias estadísticamente significativas (p<0,0001). El método E (comercial), el A (térmico) y el B (ultrasonido) lograron los mejores rendimientos en la amplificación del fragmento específico de Acanthamoeba sp. por la PCR convencional.


Abstract The objective of the study was to compare the DNA extraction of Acanthamoeba sp. cysts with a commercially available method and four non-commercial ones, with heat and ultrasound treatment that allows amplification by conventional polymerase chain reaction (PCR), reducing sample preparation and extraction times, such as a tool for diagnosis in the clinical laboratory. To this aim, a strain of Acanthamoeba T4 grown on non-nutrient agar was used. Plates with cysts at three different encystation times were stored at room temperature until the study was carried out. DNA was extracted with five methods that included pretreatments (thermal and ultrasound) or combinations of them. PCR was performed using specific primers JDP1/JDP2. Concentration and purity of DNA revealed statistically significant differences (p<0.0001) between methods. Method E (commercial), method A (thermal) and B (ultrasound) got the best yields in amplifying the specific fragment of Acanthamoeba sp. by conventional PCR.


Resumo O objetivo do estudo foi comparar a extração de DNA de cistos de Acanthamoeba sp. com um método comercialmente disponível e quatro não comerciais utilizando tratamento térmico e ultrassom para amplificação por reação em cadeia da polimerase (PCR) convencional, reduzindo os tempos de preparo e extração das amostras, como ferramenta para o diagnóstico no laboratório clínico. Foi utilizada uma cepa de Acanthamoeba, genótipo T4, cultivada em ágar não nutritivo. Os cistos para analisar foram armazenados em temperatura ambiente, correspondendo a três períodos de encistamento. O DNA foi extraído por cinco métodos: pré-tratamento térmico, ultrassom e combinações deles. A PCR foi realizada usando iniciadores específicos JDP1/JDP2. A concentração e a pureza do DNA extraído com os protocolos avaliados revelaram diferenças estatisticamente significativas (p<0,0001). Os métodos E (comercial), A (térmico) e B (ultrassom) alcançaram os melhores rendimentos na amplificação do fragmento específico de Acanthamoeba sp. por PCR convencional.


Subject(s)
Humans , Infant, Newborn , Infant , Child, Preschool , Child , DNA , Acanthamoeba , Polymerase Chain Reaction , Parasitology , Temperature , Ultrasonics , Thermic Treatment , Clinical Laboratory Techniques , Cysts , Agar , Laboratories, Clinical , Hot Temperature , Laboratories , Methods
20.
Rev. inf. cient ; 101(2)abr. 2022.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1409535

ABSTRACT

RESUMEN Introducción: La vitamina C es una sustancia que desde hace ya varios años ha suscitado debate debido a la cantidad de usos que se han demostrado. En algunos casos, las utilidades han ido desde profilaxis y acortamiento de la duración de resfriados, hasta estudios de acción en enfermedades, tales como el cáncer; los mecanismos de acción de esta han sido evaluados en forma de monoterapia o en combinación con quimioterapia para demostrar o descartar su utilidad en el cáncer. Objetivo: Demostrar si los efectos de la vitamina C fueron efectivos y si su uso, solo o en combinación con quimioterapia, es de utilidad. Método: Se realizó una investigación de tipo descriptiva documental, realizada con artículos científicos en el periodo comprendido desde 2016 hasta 2021, con un análisis detallado de los resultados del uso de la vitamina C y su posible efecto sobre los diferentes tipos de cáncer. Fueron buscados en las bases de datos de SciELO, Scopus y Medline. Resultados: La información hallada fue organizada según concentraciones plasmáticas de vitamina C y su acción en células cancerosas, dosis evaluadas de la vitamina C, mecanismos de acción en relación a células cancerígenas, desequilibrio redox, efecto específico en cánceres, vitamina C y cáncer de mama. Conclusiones: En la revisión realizada se evidencia que la vitamina C tiene un efecto benéfico en los cánceres hematopoyéticos, como: leucemia, melanoma, cáncer de mama o ciertos tipos de cáncer colorrectal y que disminuyen los efectos adversos producidos por medicamentos quimioterapéuticos.


ABSTRACT Introduction: Vitamin C is a water-soluble substance that has been in debate since a long time ago due to its wide demonstrated use. In some cases, its usage have ranged from prophylaxis and shortening the duration of colds, to studies of its action in diseases, such as cancer; Its mechanisms of action have been evaluated in the form of monotherapy or in combination with the chemotherapy to demonstrate or rule out its usefulness in cancer. Objective: To demonstrate whether the effects of vitamin C were effective and whether its use, alone or in combination with chemotherapy, is useful. Method: A documentary descriptive research was carried out, supported with scientific articles (period 2016 to 2021) which analyze in detail the results of the use of vitamin C and its possible effect on different types of cancer. Results: The information found was organized according to plasma concentrations of vitamin C, its action on cancer cells, evaluated doses of vitamin C, mechanisms of action in relation to cancer cells, redox imbalance, specific effect on cancers, vitamin C and breast cancer. Conclusions: The review shows that the use of vitamin C has a beneficial effect on hematopoietic cancers, such as leukemia, melanoma, breast cancer or certain types of colorectal cancer, and also reduces the adverse effects produced by chemotherapeutic drugs.


RESUMO Introdução: A vitamina C é uma substância que há vários anos desperta o debate devido ao número de usos que foram demonstrados. Em alguns casos, os benefícios vão desde a profilaxia e redução da duração dos resfriados, até estudos de ação em doenças, como o câncer; os mecanismos de ação deste foram avaliados como monoterapia ou em combinação com quimioterapia para provar ou descartar sua utilidade no câncer. Objetivo: Demonstrar se os efeitos da vitamina C foram eficazes e se seu uso, isoladamente ou em combinação com a quimioterapia, é útil. Método: Foi realizada uma pesquisa documental descritiva, realizada com artigos científicos no período de 2016 a 2021, com análise detalhada dos resultados do uso da vitamina C e seu possível efeito nos diferentes tipos de câncer. Eles foram pesquisados nas bases de dados SciELO, Scopus e Medline. Resultados: As informações encontradas foram organizadas de acordo com as concentrações plasmáticas de vitamina C e sua ação nas células cancerígenas, doses avaliadas de vitamina C, mecanismos de ação em relação às células cancerígenas, desequilíbrio redox, efeito específico sobre cânceres, vitamina C e câncer de mama. Conclusões: Na revisão realizada, fica evidente que a vitamina C tem efeito benéfico sobre os cânceres hematopoiéticos, como: leucemia, melanoma, câncer de mama ou certos tipos de câncer colorretal e que reduz os efeitos adversos produzidos pelos quimioterápicos.

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